Estudio del CSIC revela resistencia bacteriana en la cadena alimentaria europea

Un equipo de investigadores del CSIC ha llevado a cabo un ambicioso proyecto europeo que consiste en la secuenciación metagenómica de más de 2.000 muestras. Estas muestras provienen de materias primas, alimentos como leche, carne, pescado, queso y vegetales, así como de superficies en entornos industriales pertenecientes a 100 empresas europeas, incluyendo más de 50 situadas en la provincia de León y el Principado de Asturias. Los resultados revelan que más del 70% de los genes bacterianos asociados a la resistencia a antibióticos se encuentran presentes en la cadena de producción alimentaria, aunque solo una fracción de ellos muestra una prevalencia significativa. Los hallazgos han sido publicados en la reconocida revista Nature Microbiology.

La investigación se centra en el resistoma, que agrupa los genes que permiten a las bacterias resistir los efectos de los antibióticos. Según el investigador del CSIC Narciso M. Quijada, del Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG) en Salamanca, “aunque se sabía que la cadena alimentaria puede actuar como vía para la transmisión de bacterias resistentes a los antibióticos, hasta ahora no se había realizado un estudio tan extenso y detallado”.

Entre los genes identificados como prevalentes se encuentran aquellos que confieren resistencia a antibióticos clave, como las tetraciclinas, betalactámicos, aminoglucósidos y macrólidos. Más del 60% de las muestras analizadas contenían al menos un gen relacionado con la resistencia a antimicrobianos.

Identificación de bacterias portadoras

El estudio también ha permitido identificar las principales bacterias portadoras de estos genes. Muchas pertenecen al grupo conocido como ESKAPEE, famoso por su implicación en infecciones hospitalarias difíciles de tratar, entre ellas Escherichia coli, Staphylococcus aureus y Klebsiella pneumoniae, según explica el investigador del Instituto de Productos Lácteos de Asturias (IPLA), Abelardo Margolles.

Aparte de estas especies problemáticas, también se han detectado genes en bacterias como Staphylococcus equorum y Acinetobacter johnsonii, las cuales están asociadas con entornos alimentarios e incluso pueden tener características beneficiosas para la producción.

Peligro por transferencia genética

Cerca del 40% de los genes identificados están vinculados a elementos genéticos móviles capaces de facilitar su transferencia entre diferentes bacterias, lo que aumenta el riesgo de propagación de la resistencia. “El estudio también proporciona evidencia sobre cómo ciertos procesos industriales y condiciones específicas pueden influir en la presencia y transmisión de estos genes”, añade Quijada.

Centrando su atención en cómo evoluciona el resistoma durante el proceso productivo, los investigadores han observado que el proceso de maduración altera significativamente el contenido del resistoma en los productos finales. Los genes provienen principalmente de bacterias asociadas al proceso productivo, lo que indica una sustitución respecto a las presentes en las materias primas o fases iniciales.

Estrategias para combatir la resistencia antimicrobiana

Dichos hallazgos son cruciales para diseñar estrategias más efectivas en el uso responsable de antibióticos y desinfectantes durante la producción alimentaria. Además, contribuyen al desarrollo de políticas que busquen mitigar el creciente problema global relacionado con la resistencia a antimicrobianos.

Este estudio forma parte del proyecto europeo MASTER (Microbiome Applications for Sustainable food systems through Technologies and EnteRprise), coordinado por Teagasc (Irlanda). La coordinación del estudio ha estado a cargo de los profesores Avelino Álvarez Ordóñez y José Francisco Cobo Díaz, junto con Narciso M. Quijada. La investigación ha contado con la colaboración de destacados centros como el Instituto de Productos Lácteos de Asturias (IPLA-CSIC), el Instituto Agroquímico y Tecnología de Alimentos (IATA-CSIC), así como universidades e instituciones investigativas internacionales.

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